Единственное место стоянки для транзитных парусных яхт и моторных катеров – Пассажирский пирс №1 Геленджикского морского вокзала. Он находится в восточной части Геленджикской бухты в 1,2 мили от мыса Толстый.
В марте 2014 года на внеочередной сессии Законодательного собрания Севастополя было принято решение о создании единого Порта Севастополь на базе инфраструктуры существовавших ранее Севастопольского морского торгового порта и Севастопольского морского рыбного порта.
Порт "Крым" – небольшой порт в восточном Крыму на берегу Керченского пролива. Основное назначение порта — обслуживание Керченской паромной переправы (линия порт "Крым" — порт "Кавказ").
Морской порт "Тамань" расположен в Таманском заливе Керченского пролива. Виды деятельности – перевалка грузов на экспорт. Приоритетные грузы – нефть и нефтепродукты, сжиженные углеводородные газы, аммиак, зерно.
Евпаторийский морской торговый порт расположен на Черном море, на северном берегу Каламитского залива Евпаторийской бухты.
Ялтинский морской торговый порт специализируется на пассажирских перевозках и принимают круизные суда. Считается круизными воротами Крыма. Кроме того, порт перерабатывает каботажные грузы, в основном строительные материалы.
АО "Сочинский морской торговый порт" – коммерческое предприятие, основное направление деятельности которого, – развитие регулярных морских пассажирских перевозок и круизного туризма на черноморском побережье России.
Новороссийский морской торговый порт – один из крупнейших портов Черного моря. Он был основан в 1848 году. «Новороссийский Морской Торговый Порт» (НМТП) оказывает широкий спектр стивидорных и портовых услуг и считается крупнейшим в России портовым оператором.
Универсальный грузовой порт "Имеретинский" построен группой "Базовый Элемент" для обеспечения быстрого ввоза грузов, необходимых для строительства в Сочи объектов олимпийской инфраструктуры. Он сооружен в районе устья реки Мзымта.
Небольшой порт "Кавказ" расположен в Темрюкском районе на косе Чушка в Керченском проливе Азовского моря. Осуществляет грузовые и пассажирские перевозки.
Феодосийский морской торговый порт может перерабатывать до 40 наименований грузов. Он осуществляет перевалку нефти, нефтепродуктов, контейнеров, металлопродукции, глины, песка, лесоматериалов, продовольствия.